Phylogenetic Boom &Ziekte van Lyme

De ziekte van Lyme is een aandoening veroorzaakt door de bacterie Borrelia burgdorferi , een ziekteverwekker overgedragen door blacklegged teken . Zoals met veel andere ziekteverwekkers , hebben biologen in staat om een ​​beetje van de evolutionaire geschiedenis van B. burgdorferi te ontrafelen door middel van genetische analyse geweest . Een fylogenetische boom voor een bacterie , zoals B. burgdorferi geeft een visuele illustratie van haar relaties met andere stammen en soorten . Fylogenetische Bomen

Een fylogenetische boom toont de evolutionaire relaties tussen verschillende soorten. Elke " knooppunt " op de boom staat voor de opkomst van een nieuwe soort , en als twee soorten hun afkomst terug naar een enkele knoop kan traceren , dit knooppunt is de meest recente punt in de tijd dat deze twee soorten deelden een gemeenschappelijke voorouder . Deze bomen zijn gebouwd op basis van fysieke en genetische kenmerken , en evolutionaire biologen zijn vaak gedwongen om ze te veranderen wanneer nieuwe gegevens aan het licht komt .
Borrelia

Borrelia is eigenlijk een geslacht van bacteriën die meerdere soorten omvat . Het aantal Borrelia soorten heeft meerdere malen toegenomen in de afgelopen twee decennia als meer stammen werden geïdentificeerd . Definiëren soorten van Borrelia of andere soort van bacteriën is eigenlijk een zeer lastige probleem . Waar planten en dieren betreft , hebben biologen van oudsher gedefinieerd soorten op basis van hun onvermogen om te broeden en vruchtbare nakomelingen kunnen produceren . Een paard en ezel kunnen broeden , bijvoorbeeld, maar de muilezel die resulteert is steriel , dus paarden en ezels zijn aparte soorten. Bacteriën , echter , zich ongeslachtelijk voort , zodat deze definitie is niet relevant . Bijgevolg voor Borrelia en voor vele andere bacteriën , microbiologen definiëren soorten te onderscheiden op basis van een techniek genaamd hele DNA-DNA hybridisatie.
Relaties

Wetenschappers hebben geconstrueerd fylogenetische bomen voor Borrelia soorten gebaseerd op een techniek genaamd multilocus sequentie-analyse ( MLSA ) , waarbij wordt gekeken naar de verschillen tussen specifieke " housekeeping" genen aanwezig in alle verschillende soorten . Biologen gebruiken deze software om de "meest spaarzame boom " te bouwen - De fylogenetische boom die het kleinste aantal evolutionaire veranderingen vereist de waargenomen verschillen verklaren. Resultaten van deze methode is echter , moeten vaak worden verfijnd als er nieuwe informatie beschikbaar komt .
Relaties

Momenteel B. burgdorferi sensu stricto deelt haar meest recente gemeenschappelijke voorouder met B. bissettii; deze twee op hun beurt delen een gemeenschappelijke voorouder met B. lusitaniae . Alle drie de soorten wijken af ​​van een gemeenschappelijke voorouder delen ze met B. afzelii , B. spielmanii , B. garinii en B. bavariensis . Deze groep van soorten zijn beurt afweken van een gemeenschappelijke voorouder delen met B. valaisiana . Het is belangrijk op te merken echter op dat deze fylogenetische boom zeer goed zou kunnen in de toekomst veranderen als nieuwe gegevens aan het licht komt . In het bijzonder , het is heel goed mogelijk dat de dalende kosten van genoom kunnen hebben voor de manier waarop fylogenetische bomen worden ontwikkeld voor bacteriën zoals B. burgdorferi .